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    啥是MPN?(入門(mén)篇)

    發(fā)布時(shí)間: 2020-09-04

    導讀


    本文分入門(mén)篇進(jìn)階篇。本期是入門(mén)篇,主要闡述MPN的歷史和意義,幫你理解MPN。主要是意會(huì )。進(jìn)階篇會(huì )告知MPN的數學(xué)原理,就是MPN值是怎么算出來(lái)的。進(jìn)階篇閱讀有難度,需具備一定的數學(xué)基礎。

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    引子


    剛入職的小明成了一名光榮的微生物試驗員,在工作幾天后,他懷著(zhù)崇敬而期待的心情問(wèn)了師父一個(gè)問(wèn)題:“啥是MPN?”

    師父平靜的回答:“最大可能數”

    小明想了想,怯怯的又問(wèn):“那啥是最大可能數?”

    師父故作高深的回答:“是一種用統計學(xué)算出來(lái)的樣品中最可能的數!”

    小明又想了想,又問(wèn):“這個(gè)數有什么意義?它是怎么算的?”

    師父悠悠的回了一句:“今天的培養皿都洗了么?三角瓶呢?鹽水滅了沒(méi)?”

    小明聽(tīng)聞,驚恐而遁。

    師父凝望小明背影,回身遙望窗外,心想:“20年了,我干這行20年了,當年我也是這么問(wèn)的師父,但是沒(méi)有答案,誰(shuí)能告訴我啊,啥是MPN~~~~~~~~~~~~”


    啥是MPN?(入門(mén)篇)


    入門(mén)篇

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    要想說(shuō)清楚MPN,就首先要了解發(fā)酵管計數法(稀釋計數法)。

    有些樣品是不適合用平板法計數的,比如菌含量很低的,或者有雜質(zhì)干擾的樣品。菌含量很低的樣品中最典型的是水。所以發(fā)酵管計數法主要用于水質(zhì)中大腸類(lèi)細菌的檢測。有資料顯示這種方法最早出現在1875年前后,巴斯德用此種方法做過(guò)菌數檢測,之后李斯特等人也用過(guò)這種方法,20世紀初已經(jīng)廣泛應用于水質(zhì)檢測。

    那么發(fā)酵管法是怎么計數的呢?其實(shí)很簡(jiǎn)單,比如一個(gè)水樣,將其稀釋10倍、100倍和1000倍,每個(gè)稀釋度分別取1mL稀釋液接種1管發(fā)酵管(比如乳糖膽鹽肉湯)。如果10倍和100倍生長(cháng),1000倍不生長(cháng),那么可以粗略的認為1mL水樣中的菌含量在100-1000個(gè)之間。

    后來(lái)又有進(jìn)步。比如還按上面的例子,稀釋倍數不變,每個(gè)稀釋度接種管數從1管變成5管,培養后10倍5管全長(cháng),100倍5管有4管生長(cháng),1000倍都不長(cháng)。那么計算方式改為啥是MPN?(入門(mén)篇)。結果就變成了1mL水樣中的菌含量是80個(gè)。

    是不是先進(jìn)了很多?但是以你今天的眼光看,這簡(jiǎn)直弱爆了,對么?

    但是你考慮過(guò)么?當時(shí)的中國還處于清朝。

    頓時(shí),你是不是又覺(jué)得,這簡(jiǎn)直太先進(jìn)了~~~~

    啥是MPN?(入門(mén)篇)


    這種發(fā)酵管計數的結果不準,你看到了。還有一個(gè)人也看到了,他就是M. H. McCrady,就職于加拿大魁北克省衛生委員會(huì )實(shí)驗室。1915年一篇雄文問(wèn)世,MPN的名號從此響徹江湖。

    《The Numerical Interpretation of Fermentation-Tube Results》(譯:發(fā)酵管結果的數值解釋?zhuān)?/strong>,發(fā)表于美國《傳染病雜志》。他用概率論方法分析了發(fā)酵管計數的結果,從而第一次提出了MPNMost Probable Number的叫法,并算出了最早的MPN。


    啥是MPN?(入門(mén)篇)


    之后,專(zhuān)業(yè)的數學(xué)家紛紛登場(chǎng),開(kāi)始將此方法進(jìn)行完善。Halvorson和Ziegler(1933),Eisenhart和Wilson(1943)和Cochran(1950)發(fā)表了有關(guān)MPN法統計學(xué)基礎的文章。 Woodward(1957)建議MPN表應省略那些不可能的陽(yáng)性組合(如:0-0-3)。 De Man(1983)發(fā)布了置信區間方法。

    至此,MPN法才變成了今天我們看到的樣子。

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    好了,背景介紹完了,現在開(kāi)始幫助大家理解MPN的意義。這里會(huì )提到一些統計學(xué)的概念,但沒(méi)有計算,計算留在進(jìn)階篇。沒(méi)辦法,MPN畢竟是統計學(xué)基礎上算出來(lái)的,想一點(diǎn)統計學(xué)概念不提就解釋清楚太難了。

    我們以大腸菌群MPN法為例。我們把1mL樣品接入一管LST,培養后結果只會(huì )有兩種可能,產(chǎn)氣或不產(chǎn)氣。從根源上說(shuō)就是陽(yáng)性或陰性。那么這種只有兩種結果的試驗,在統計學(xué)上叫伯努利試驗。生活中還有很多例子,比如電源只有開(kāi)和關(guān),比如拋硬幣,只有正面和反面。沒(méi)有中間的立場(chǎng),沒(méi)有妥協(xié)的余地。

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    我們MPN法試驗一般都是9管,3個(gè)稀釋度,每個(gè)稀釋度3管。那么相當于把伯努利試驗分了3組,每組做了3次。每組內的3管之間的結果沒(méi)有相互干擾,是相互獨立的,發(fā)生的概率也是一樣的。這種每組內的3次試驗就叫n重伯努利試驗。比如拋硬幣,你連續拋20次,每次只有兩種可能,正面和反面,而且第一次拋出的結果,對第二次拋出正面還是反面沒(méi)有任何影響。

    至此,基本概念已經(jīng)建立起來(lái),為了幫助理解,我們拋開(kāi)微生物,開(kāi)始玩拋硬幣游戲。


    啥是MPN?(入門(mén)篇)


    準備一個(gè)硬幣,連續拋20次,請問(wèn)正面能有幾次?

    理論上,0-20次,皆有可能。有人運氣無(wú)敵,連續20次正面。有人運氣也無(wú)敵,一個(gè)正面都沒(méi)有。到底最可能幾次正面呢?伯努利概型是有公式的,所以來(lái)看計算結果吧。


    啥是MPN?(入門(mén)篇)


    表格不好看? 那我們換成圖。


    啥是MPN?(入門(mén)篇)


    從這個(gè)圖看,是不是一目了然。這就是二項式分布,也叫伯努利分布。在0-20次正面的所有可能中,得到10次正面的概率最高。那么10次就是拋20次硬幣后,最可能得到的正面次數。也可以說(shuō),是這個(gè)命題下的最大可能數。

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    明白了么?MPN值就是在現有因素下能推算出的微生物含量概率最大的那個(gè)濃度。

    MPN法不像平板法,平板法能直觀(guān)的去數平板上的菌數,所以平板法得到的結果是真實(shí)的,是你試驗出來(lái)的,數出來(lái)的。而MPN法的結果是通過(guò)幾根試管的陰陽(yáng)性,通過(guò)統計學(xué)推算出的樣品中的最可能的濃度。由于這個(gè)結果是推算的,為了與平板法的真實(shí)結果相區分,所以有了新的單位MPN。

    比如試管陽(yáng)性2-1-0,通過(guò)MPN表查的結果是15,置信區間3.7-42?,F在單位是15MPN/g,如果改成15個(gè)菌/g,你是不是就更好理解了?

    這里面的3.7-42,就類(lèi)似上述拋硬幣游戲正面次數的范圍0-20,只是范圍更小,因為是95%置信區間。15就相當于拋硬幣最可能的那個(gè)10。

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    還不明白?那請從入門(mén)篇再讀一邊。再讀還不明白?那就默默點(diǎn)左上角的叉叉?。?!


    啥是MPN?(入門(mén)篇)


    拋硬幣出現10次正面的概率并沒(méi)有想象中的那么高,只有17.6%,但是這已經(jīng)是最可能出現的數了。你會(huì )不會(huì )覺(jué)得MPN法的結果不準?不用擔心。McCrady先生當年都做過(guò)試驗驗證過(guò),準的。

    試驗是這么做的。做大腸檢測,用同一份樣液,做了76組,每組10管。每組的10mL接種液是一次取出,再分別加入10支試管。一共做了760支,最終陽(yáng)性管數597支,然后又用陽(yáng)性率計算出了10支試管中陽(yáng)性管數的分布,發(fā)現和實(shí)際試驗情況基本一致。具體看下表。


    啥是MPN?(入門(mén)篇)


    左側起,第一列是10管中陽(yáng)性的管數,比如4/10,就是一組10支有4支陽(yáng)性。第二列是當時(shí)做試驗的情況,第三列是通過(guò)概率計算出的情況。

    例如,我們以7/10為例,就是10支試管有7支陽(yáng)性的,試驗中76組試驗,每組7支陽(yáng)性的組數是15組,而概率計算得出的組數是17組,所以偏差不是很大,整體試驗情況和理論計算情況基本一致。說(shuō)明統計學(xué)計算在微生物領(lǐng)域是適用的,MPN法的準確性是靠譜的。

    拋硬幣的概率是明確的,正面的概率就是0.5,所以很好計算,圖形也很對稱(chēng)。但微生物的實(shí)際情況是我們不知道陰陽(yáng)性的概率。那么在下期的進(jìn)階篇,我們就會(huì )看到如何假設一個(gè)概率,又如何通過(guò)這個(gè)假設的概率算出樣品中微生物的濃度。

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    參考文獻:


    1.? McCrady, M. H. 1915. The numerical interpretation of fermentation-tube results. J. Infect. Dis. 17:183-212.

    2.? U.S. Food & Drug Administration. BAM Appendix 2: Most Probable Number from Serial Dilutions.

    3.? 王明慈, 沈恒范. 概率論與數理統計. 高等教育出版社. 1999年.


    未完待續


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